ChimeraXのコマンド 覚書 20200221

Volume Viewerをだす

@ GUI
Tools >Volume Data > Volume User
Voly

Volume Viewer

SIde Viewをorthologにする or monoにする

@Command Line

camera ortho

camera ortho

camera mono

camera mono

Volumeのorigin変更

例としてもともとorigin 0,0,0から199,0,0へ移動するとき @Command Line

volume origin 199,0,0

volume

HIde dast

1のマップのダストを隠す。

surface dust #1

Clip

@GUI
Right Mouse > Clipで右クリックしながら画面操作すると画面上のマップやモデルを好きな方向に切る（クリップ）できる。
このときサイドビューはいじっていない。

Clip right mouse

Clipしている時のSide view

クリップの設定を解除するときは
@Command Line

~clip

画像を背景透明化して保存

save image [保存するディレクトリ]/[保存ファイル名].png width [横幅] height [縦幅] transparentBackground true

Ex

save image /Users/hoge/Desktop/hogehoge.png width 1301 height 1049 transparentBackground true

.png以外にも.gif,tif,.jpgもOK
背景透明にしたいならpngかtiff（だったはず）